党的十一届三中全会以后，学校逐步停止了各种政治运动，制定了《南京气象学院综合改革方案》，开展了管理体制、教育教学、科学研究、师资队伍、后勤等方面的综合改革，被中国气象局批准为全国气象部门综合改革试点单位。通过改革，各项工作走向良性发展轨道，有力地推动了学校事业发展。

* 1978年2月17日，国务院转发教育部《关于恢复和办好全国重点高等学校的报告》，南京气象学院被确定为全国重点大学

* 1978年4月，中央气象局下发了学校《关于一九七八－一九八一年基本建设任务书的批复》，对被列为全国重点大学之后学校的办学规模、专业、基建任务做出了新的安排

* 1984年4月，全国气象教育工作会议在我校召开

1992年10月，气象院校改革研讨会在学校召开，学校被中国气象局批准为全国气象部门综合改革试点单位，制订了《南京气象学院综合改革方案》。方案包括加强课程建设方案、青年教师培养工作暂行规定、各类人员定编切块方案、奖酬金发放办法实施方案等9个配套方案及考核评估指标体系。

* 1992年10月，气象院校改革研讨会在学校召开

* 1992年10月，气象院校改革研讨会代表合影

* 1995年10月27日，邹竞蒙局长题词：“科教兴国，科教兴气象，南气要先行”

* 1996年，中国气象局局长邹竞蒙在中层干部大会上讲话

* 1998年4月13日，温克刚局长题词：“加快改革发展步伐，为气象现代化建设培养优秀人才”

* 1998年3月，学校制定了“今后5～10年现代化建设规划”，提出今后5～10年发展目标是：坚持以党的十五大精神和邓小平理论为指针，全面加快现代化建设，经过努力，把我院建设成国内达到先进，在国际上有影响，某些重点学科专业达到国际先进水平，以大气科学和环境科学为特色兼有其他相关学科的理工为主的多科性局属全国重点大学